More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 446 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  34.77 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  33.64 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  31.76 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  32.58 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  32.58 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  32.58 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  36.62 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  30.22 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30.45 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 412 aa  90.1  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.14 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.93 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.14 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  28.84 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.67 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.87 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.87 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.17 
 
 		 1833 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.86 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.58 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.58 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.97 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.35 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.35 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.35 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.82 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.84 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  25.17 
 
 		 406 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.06 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.51 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  23.64 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  23.64 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  23.4 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  24.13 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  29.47 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  23.78 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  26.61 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>