More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2357 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
418 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  85.23 
 
 
414 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
429 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  49 
 
 
424 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
422 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  36.36 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  38.89 
 
 
412 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  37.37 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
428 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
417 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  31.7 
 
 
445 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.75 
 
 
414 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  32.21 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.87 
 
 
408 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.59 
 
 
408 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.59 
 
 
408 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.59 
 
 
408 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.59 
 
 
408 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.32 
 
 
408 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
401 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  29.22 
 
 
418 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  29.22 
 
 
418 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  29.22 
 
 
418 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
442 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.37 
 
 
436 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  28.01 
 
 
412 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.59 
 
 
408 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
431 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
440 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.44 
 
 
390 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.44 
 
 
390 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  29.51 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  30.36 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.12 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  20.63 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  32.74 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.44 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.25 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.19 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.54 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.16 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.66 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.16 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.34 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  22.14 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.96 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.72 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.72 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.62 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.72 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  26.72 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.51 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.64 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  26.13 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  26.13 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.78 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.23 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.67 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.03 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  24.46 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.32 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.32 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.48 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.11 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.36 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.43 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.81 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.26 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.04 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.18 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  27.09 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>