More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1928 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  816    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  28.24 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  26.58 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.03 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0931  hypothetical protein  58.33 
 
 		 166 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.45 
 
 		 1833 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.68 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.12 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.68 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.84 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.7 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  28.24 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  28.24 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.34 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.65 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.42 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  28.35 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.42 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.16 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.68 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.83 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.37 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.68 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.16 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  28.12 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.35 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.05 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.55 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.77 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.25 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.22 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 425 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  23.2 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.18 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.18 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  26.65 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.61 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 524 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.74 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.56 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.62 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>