More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2483 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  87.14 
 
 		 412 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  35.06 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  36 
 
 		 424 aa  160  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  31.01 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.59 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  31.01 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  31.01 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  30.87 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  29.44 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.38 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  28.92 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.08 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.14 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.14 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.28 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.28 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.01 
 
 		 1833 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.14 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.61 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.74 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  29.25 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.22 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.06 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.3 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.49 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.14 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.04 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.04 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  27.62 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  29.21 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  28.12 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  19.94 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  23.51 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.87 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.76 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.73 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  25.89 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  25.89 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.74 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.01 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.31 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.81 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  22.49 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.06 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.81 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  29.12 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>