131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2001 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  824    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1625  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.776892  normal  0.880919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0659  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 423 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.82 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  27.46 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  29.47 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  29.47 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  29.22 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  30.88 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  32.46 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  32.46 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.4 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.42 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.25 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  22.36 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.06 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  27.78 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  30.05 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  31.71 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  25 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.94 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  23.26 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  29.64 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.14 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.14 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.43 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.14 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  22.98 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  24.69 
 
 		 618 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0055  hypothetical protein  26.25 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.89 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.89 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>