153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0659 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0659  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1625  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.776892  normal  0.880919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  25.55 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  24.48 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  24.48 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  24.48 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.29 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.69 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.34 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.34 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.34 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.34 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  20.73 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.29 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  30.5 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  32.39 
 
 		 526 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.48 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  26.16 
 
 		 542 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.08 
 
 		 1833 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.09 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.1 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  26.06 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  24.04 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.09 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.06 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.48 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.48 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  20.8 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.09 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.1 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  28.53 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  20.8 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.18 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.18 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  33.54 
 
 		 529 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.19 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.1 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  35.11 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  35.11 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  36.5 
 
 		 542 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  27.36 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  20.82 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.37 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.09 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  20.51 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  20.54 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>