More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4461 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  83.29 
 
 
418 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  83.29 
 
 
418 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  100 
 
 
414 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  83.29 
 
 
418 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  88.78 
 
 
412 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  69.83 
 
 
419 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  52.57 
 
 
445 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  53.93 
 
 
478 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
417 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
430 aa  145  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  34.36 
 
 
469 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 
446 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  32.39 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
429 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.53 
 
 
405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.53 
 
 
405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.27 
 
 
412 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  28.95 
 
 
412 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.39 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.42 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  27.87 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  27.71 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  27.84 
 
 
410 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.13 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
453 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.01 
 
 
474 aa  89.7  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.61 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.7 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
463 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.57 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
426 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.65 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  28.82 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.78 
 
 
1833 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.77 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.68 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.3 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.88 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.22 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.88 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.51 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.6 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  29.31 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.38 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.94 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.39 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.86 
 
 
1816 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.06 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  26.74 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.74 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  32.88 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.54 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.5 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.5 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  28.15 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.45 
 
 
431 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
435 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.68 
 
 
457 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.54 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.95 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.24 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.94 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.87 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.54 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.39 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  28.44 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  28.13 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  23.7 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  21.67 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.02 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.22 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>