More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4032 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  100 
 
 		 418 aa  798    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  100 
 
 		 418 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  83.29 
 
 		 414 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  99.76 
 
 		 418 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  83.75 
 
 		 412 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  68.8 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  52.37 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 478 aa  332  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  33.25 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  32.08 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.96 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.05 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  29.44 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.1 
 
 		 1816 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.79 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.65 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.65 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.81 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.85 
 
 		 1833 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.81 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.08 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  24.57 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.41 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  27.72 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.19 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  26.09 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.68 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.99 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.13 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.54 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.26 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.48 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.13 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.26 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 524 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.52 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  27.07 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.68 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.32 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>