101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1625 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1625  major facilitator transporter  100 
 
 		 500 aa  948    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.776892  normal  0.880919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0659  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  21.35 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  21.88 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  21.6 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  21.35 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  21.35 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  21.61 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  26.04 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  21.61 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  31.25 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 406 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 421 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  22.61 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 431 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 397 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  25.63 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  25.63 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 366 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  25.35 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  22.37 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  25.59 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  21.1 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28.63 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 414 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 407 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.07 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  20.57 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  21.73 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  21.41 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  21.41 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  23.26 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.52 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  23.14 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.38 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  22.89 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 405 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.45 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.84 
 
 		 209 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.33 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  29.37 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  26.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  28.54 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.25 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.15 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.35 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.79 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.24 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.28 
 
 		 403 aa  44.3  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 446 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  24.29 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.35 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 420 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.56 
 
 		 408 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 431 aa  43.9  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  22.89 
 
 		 406 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 445 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>