More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3535 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  100 
 
 		 366 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 433 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.63 
 
 		 417 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.41 
 
 		 410 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 432 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  26.51 
 
 		 412 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.63 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25.56 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.63 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 440 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 422 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.58 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.86 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  25.28 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  25.28 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.14 
 
 		 434 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  25.35 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.77 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.85 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  24.77 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.85 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.55 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.85 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.85 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.55 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.55 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.59 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.55 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.55 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  25 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  29.18 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  24.93 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  26.15 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  25.6 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  25.6 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.21 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  24.46 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.34 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  25 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.34 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  26.74 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  25 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  25 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.34 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  26.74 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.78 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  26.55 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.36 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  20.49 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  27.25 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  26.82 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  26.87 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.22 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  26.67 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  26.87 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  24.73 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>