More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0536 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  839    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  72.08 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 
440 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 
458 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 
415 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  47.16 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  46.48 
 
 
397 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
406 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  37.56 
 
 
485 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
412 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  33.17 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.24 
 
 
411 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  30.1 
 
 
405 aa  169  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
407 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  32.68 
 
 
430 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  33.51 
 
 
450 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  31.03 
 
 
394 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  25.32 
 
 
410 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.4 
 
 
1833 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.43 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  31.14 
 
 
425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 
1816 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  31.57 
 
 
411 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
437 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  30.85 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.01 
 
 
414 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  28.93 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
432 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.73 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.98 
 
 
438 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.87 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.26 
 
 
422 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.21 
 
 
1876 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
448 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.6 
 
 
422 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.87 
 
 
422 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.87 
 
 
422 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.67 
 
 
422 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.6 
 
 
422 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.6 
 
 
422 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.13 
 
 
422 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.96 
 
 
448 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
442 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.88 
 
 
413 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.88 
 
 
413 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.53 
 
 
424 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.65 
 
 
445 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  21.64 
 
 
422 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.87 
 
 
439 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
410 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  27.06 
 
 
1769 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.71 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.3 
 
 
1829 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
461 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
499 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.23 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.23 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.97 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  26.53 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.45 
 
 
1864 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.34 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.05 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.25 
 
 
1806 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 
415 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.05 
 
 
1776 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  23.56 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.74 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  22.55 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  22.79 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  22.89 
 
 
423 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.79 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.19 
 
 
446 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.7 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.86 
 
 
450 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
494 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  26 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  23.3 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  22.55 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>