More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2289 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  817    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.37 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.12 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.12 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.82 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.06 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.12 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  33.08 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.06 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.61 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  29.82 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  29.82 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 474 aa  86.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30.41 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  33.44 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  26.45 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.18 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  26.46 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  26.46 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.08 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  22.31 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  22.31 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.31 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  22.31 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  22.31 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.94 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.94 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  22.31 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.5 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  26.45 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  22.51 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  21.51 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2754  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.622633  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.98 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  26.02 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  21.77 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  33.15 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  30.6 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  21.9 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.1 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  26.25 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  24.29 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1033  hypothetical protein  20.22 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>