More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2819 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
462 aa  879    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 
428 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  50.47 
 
 
443 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 
424 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  49.03 
 
 
424 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  49.03 
 
 
424 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  49.28 
 
 
443 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  41.84 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
433 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  28.99 
 
 
418 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
421 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
433 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
431 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.97 
 
 
415 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.86 
 
 
415 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.39 
 
 
417 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.78 
 
 
474 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  33 
 
 
432 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.73 
 
 
415 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
435 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  30.59 
 
 
431 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  25.69 
 
 
362 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.71 
 
 
413 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.97 
 
 
415 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.97 
 
 
415 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.97 
 
 
415 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.31 
 
 
415 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.97 
 
 
415 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.97 
 
 
415 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.45 
 
 
436 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
459 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.56 
 
 
426 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.24 
 
 
415 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.84 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.72 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  30.5 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.47 
 
 
426 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  31.39 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.12 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.82 
 
 
474 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.93 
 
 
446 aa  93.2  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.18 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  25.84 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.48 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.57 
 
 
420 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.32 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.51 
 
 
441 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  28.4 
 
 
419 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
440 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
410 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.08 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.66 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  25.84 
 
 
406 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25.84 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.23 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.52 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  25.73 
 
 
393 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
420 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.55 
 
 
432 aa  87.4  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  26.04 
 
 
406 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.63 
 
 
431 aa  87  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  26.04 
 
 
406 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
441 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  27.67 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
442 aa  86.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
416 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.92 
 
 
1833 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.92 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.92 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.48 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.48 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.48 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.18 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  29.55 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.57 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  27.91 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.19 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.05 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  26.14 
 
 
542 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.09 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.73 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>