More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0310 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  83.06 
 
 		 428 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  54.31 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  54.31 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  52.82 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  47.8 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  50.34 
 
 		 462 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  29.97 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.24 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.76 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  25 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  25 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  25 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  25 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.16 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25.24 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  25.24 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.77 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  28.87 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 418 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 429 aa  86.7  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 417 aa  86.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.18 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  28.37 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.6 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  24.66 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  27.27 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  30.5 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  28.06 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  29.55 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.03 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  27 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  29.58 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  29.58 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  29.58 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  29.58 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  29.58 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  23.26 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  24.48 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  25.8 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.43 
 
 		 1833 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  27.34 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>