More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0092 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  791    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  27.98 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  27.98 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  29.88 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  27.93 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.23 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  28.42 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.15 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.15 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.23 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.51 
 
 		 1833 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.96 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.61 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.18 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.85 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.07 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  28.53 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.9 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.92 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  21.71 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.63 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  23.51 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.63 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2572  major facilitator transporter  21.34 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  31.28 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2520  major facilitator transporter  21.34 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.63 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.4 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.89 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.89 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.28 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  31.97 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.61 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.86 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.83 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  27.89 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.47 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  22.43 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.46 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.15 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.3 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.12 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  27.67 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.85 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>