More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1339 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
429 aa  798    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  35.93 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.88 
 
 
420 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.64 
 
 
420 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.4 
 
 
420 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.4 
 
 
420 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.25 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.21 
 
 
420 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.76 
 
 
420 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.7 
 
 
420 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.61 
 
 
418 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.63 
 
 
450 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.41 
 
 
436 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
412 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
428 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
429 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.07 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.49 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.24 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.49 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.81 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.49 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.49 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.49 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
440 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.55 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
456 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.16 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.2 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
442 aa  96.3  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
441 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.99 
 
 
420 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.83 
 
 
415 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.89 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.7 
 
 
474 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.73 
 
 
430 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
421 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  25.06 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.82 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.21 
 
 
424 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.21 
 
 
424 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.76 
 
 
426 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.01 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
440 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.71 
 
 
524 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.29 
 
 
424 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.71 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.2 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.43 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.36 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  26.93 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.99 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.99 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.72 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  33.33 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.57 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.2 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.78 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25.73 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.99 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.2 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.87 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.54 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.54 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.54 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2839  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  30.42 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  31.1 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.1 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  23.56 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.2 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.82 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  20.6 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  26.14 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.06 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>