More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0369 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  812    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  48.91 
 
 
423 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  44.53 
 
 
427 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  44.99 
 
 
413 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  44.99 
 
 
413 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
432 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
433 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 
444 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  32.65 
 
 
422 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  32.81 
 
 
422 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  32.11 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  31.84 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  31.94 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.68 
 
 
422 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  30.71 
 
 
422 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  30.69 
 
 
422 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  31.41 
 
 
422 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  31.15 
 
 
422 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  31.15 
 
 
422 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  30.69 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  30.69 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  31.95 
 
 
432 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  31.95 
 
 
431 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  31.7 
 
 
434 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  31.7 
 
 
434 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  31.96 
 
 
434 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  31.96 
 
 
434 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  31.96 
 
 
434 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  32.19 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  31.44 
 
 
434 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.75 
 
 
414 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  29.26 
 
 
414 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  28.01 
 
 
415 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  28.01 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  28.38 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  28.16 
 
 
417 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
415 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
405 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  30.22 
 
 
412 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  29.38 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  27.92 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  28.17 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  28.17 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  26.2 
 
 
421 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.63 
 
 
408 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.25 
 
 
408 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.67 
 
 
408 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.84 
 
 
408 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  27.11 
 
 
408 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.77 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.27 
 
 
1816 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.63 
 
 
408 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.63 
 
 
408 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.57 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.01 
 
 
404 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
420 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.46 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.94 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
440 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
463 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  34.72 
 
 
404 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.15 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.41 
 
 
420 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  29.87 
 
 
420 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  34.26 
 
 
404 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.41 
 
 
420 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  34.26 
 
 
404 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  25.34 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.16 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.16 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.65 
 
 
420 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.16 
 
 
420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  34.26 
 
 
404 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.86 
 
 
434 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.6 
 
 
420 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  34.11 
 
 
404 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.25 
 
 
427 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.38 
 
 
1806 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
412 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  28.77 
 
 
366 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.93 
 
 
406 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  27.72 
 
 
296 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.5 
 
 
439 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.38 
 
 
1833 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.57 
 
 
404 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.02 
 
 
413 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.92 
 
 
418 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  24.59 
 
 
419 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 
432 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  23.34 
 
 
441 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  26.63 
 
 
416 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  26.72 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.44 
 
 
436 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>