More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3471 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  830    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  25.71 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  27.09 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.99 
 
 		 1839 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  24.59 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.25 
 
 		 1806 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  27.89 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  24.04 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  24.04 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  24.23 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  23.61 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.19 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.95 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  26.84 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.45 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.19 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  21.66 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.58 
 
 		 1833 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.59 
 
 		 1864 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.84 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.84 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.84 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.84 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.84 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  27.37 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.93 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.93 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  21.39 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.07 
 
 		 1829 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.93 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.84 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25.35 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.88 
 
 		 1876 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.05 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.12 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.68 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  30.56 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.37 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  27.93 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  21.84 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.68 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  29.11 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.37 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  24.55 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  23.05 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  23.05 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  22.19 
 
 		 1769 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  27.12 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  21.99 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  19.93 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  27.12 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  27.68 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  19.93 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  28.85 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  27.12 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  30.05 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.04 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.12 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>