61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5457 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  62 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  62 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  62 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  60.9 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  62.05 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  61.29 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  53.85 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  51.69 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  51.13 
 
 		 404 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  26.15 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  24.13 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  24.13 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  24.27 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  32.54 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.18 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  30.15 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  29.41 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.52 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  28.68 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  31.85 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.37 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.75 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  23.62 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.69 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.69 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  23.62 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.69 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  23.62 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.69 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.27 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  21.92 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.83 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.47 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.47 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  21.85 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.43 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.27 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>