22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3493 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  879    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 		 409 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 419 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  25.82 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  25.29 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  24.56 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.06 
 
 		 1839 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  23.1 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  21.33 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>