96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0335 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  85.15 
 
 		 404 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  77.96 
 
 		 395 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  53.02 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  53.79 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  55.09 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  27.27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.45 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.45 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  21.97 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.45 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  39.18 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.81 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.81 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.81 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.81 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  19.93 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.56 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  18.56 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  24.19 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  23.32 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.37 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  22.49 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.49 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.49 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  17.37 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.75 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.58 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  20.66 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.83 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  26.88 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  28.29 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.29 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.29 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  26.05 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.29 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  26.05 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.29 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  26.05 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.22 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.17 
 
 		 1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.92 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.45 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.45 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  28.57 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  22.15 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  22.44 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  28.39 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.97 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.49 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.91 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  23.2 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>