53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1271 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  91.81 
 
 		 402 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  67.96 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  62.86 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  62.06 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  62.06 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  61.81 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  57.26 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  56.41 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  54.43 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  29.81 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  29.81 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  29.81 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  28.46 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  32.49 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.81 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.03 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.03 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  24.6 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.38 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.33 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 476 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  26.56 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.38 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 432 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.38 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>