109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3362 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  85.15 
 
 		 408 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  77.71 
 
 		 395 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  54.43 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.29 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  34.69 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.24 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  25.86 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  25.86 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  25.86 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  25.87 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  20.73 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.14 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  20.73 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  20.87 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2640  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.57 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.57 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.57 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.17 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  19.27 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  19.85 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  21.41 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  21.41 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 499 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.06 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.41 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  21.3 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.15 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  21.09 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.97 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.49 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.97 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.47 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.97 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  26.37 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.97 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.97 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.64 
 
 		 209 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  19.51 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.37 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  20.87 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.17 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.45 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  24.25 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  24.25 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  26.51 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  24.25 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.84 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.52 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  19.55 
 
 		 1833 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  27.82 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  20.83 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>