More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2250 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  800    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  800    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1780  transporter, putative  75.13 
 
 
393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
409 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
423 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.67 
 
 
436 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
440 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  28 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.15 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
414 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.97 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.47 
 
 
430 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  26.67 
 
 
414 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
433 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.11 
 
 
447 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  27.78 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.19 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
412 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.2 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  26.43 
 
 
412 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
419 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  24.94 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.6 
 
 
441 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  24.62 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  24.94 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.19 
 
 
414 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
414 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
410 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
401 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
453 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
414 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.8 
 
 
418 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  26.71 
 
 
414 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.4 
 
 
418 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.78 
 
 
426 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
456 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.51 
 
 
426 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.74 
 
 
410 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
418 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
450 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  25.13 
 
 
435 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  25.69 
 
 
441 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 
403 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.5 
 
 
429 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.19 
 
 
446 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.94 
 
 
412 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
428 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
440 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
419 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
378 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  24.05 
 
 
452 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
446 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  22.19 
 
 
423 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.51 
 
 
410 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  23.32 
 
 
441 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  23.33 
 
 
535 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  26.65 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
420 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  24.49 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.32 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  24.49 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  23.49 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  24.94 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
403 aa  96.3  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.27 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  24.81 
 
 
549 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.14 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
431 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
417 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
425 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  25.44 
 
 
532 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  24.49 
 
 
543 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  24.04 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
476 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.52 
 
 
474 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.24 
 
 
413 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  24.93 
 
 
416 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  22.73 
 
 
551 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  23.76 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  25.73 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  25.38 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.83 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  25.41 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  24.18 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  25.07 
 
 
553 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
404 aa  89.4  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  23.97 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  23.88 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.48 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>