12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3504 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  32.37 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>