39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3279 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  91.81 
 
 		 403 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  65.65 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  61.5 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  62.18 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  62.18 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  61.93 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  56.98 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  55.27 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  27.82 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  27.82 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  27.82 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  28.07 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  27.92 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  31.79 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  28.91 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 475 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>