21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2672 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  831    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  99.7 
 
 
328 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  90.39 
 
 
406 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  99.67 
 
 
304 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  99.67 
 
 
304 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3167  hypothetical protein  98.31 
 
 
59 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0439937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  26.29 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  24.32 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  24.51 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2147  major facilitator family protein  96.23 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  24.81 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  25.21 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  25.21 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  26.27 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  26.99 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  25.28 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  24.65 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 
499 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>