94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5029 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  67.96 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  62.02 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  55.71 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  54.86 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.5 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.57 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  27.08 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  27.08 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  27.08 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  25.52 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  20.95 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  23.91 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  23.91 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  20.7 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  20.7 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  20.7 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  23.91 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  22.83 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.52 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  25.21 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.86 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.52 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  22.96 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  22.96 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  22.96 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.52 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  22.4 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  32.21 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  26.63 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  26.63 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  26.63 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.14 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  20.49 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  21.46 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.23 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  21.63 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  20.73 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.97 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.43 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.9 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.43 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  21.49 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23.98 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  21.23 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  21.49 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.51 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.23 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  25.84 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  27.45 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  20.19 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  18.77 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  21.19 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.46 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  19.32 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.43 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  24.16 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  26.57 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3270  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  24.82 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  18.32 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  34.62 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>