131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7935 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  36.79 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  36.57 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  36.62 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  31.61 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 442 aa  99.4  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  30.51 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.33 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.08 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.08 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  27.75 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.83 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.68 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.83 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.68 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.94 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.88 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.6 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.52 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.47 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  33.33 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  27.82 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  28.71 
 
 		 424 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.28 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.28 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  25.26 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.7 
 
 		 901 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  21.78 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.41 
 
 		 686 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.68 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  24.73 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.57 
 
 		 688 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  29.69 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.45 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.03 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  28.68 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  25.74 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2460  macrolide-efflux protein  25.77 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  26.98 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.71 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2876  macrolide-efflux protein  25.77 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 710 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>