More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0293 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 710 aa  1388    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  56.67 
 
 		 642 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.75 
 
 		 707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  38.37 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.53 
 
 		 686 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  38.44 
 
 		 709 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 901 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 730 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  38.42 
 
 		 686 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 688 aa  351  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  37.3 
 
 		 705 aa  340  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.52 
 
 		 703 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  34.12 
 
 		 662 aa  284  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 727 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 725 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  35.04 
 
 		 707 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 671 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.35 
 
 		 213 aa  111  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 222 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  34.55 
 
 		 209 aa  94.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 397 aa  93.6  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  34.05 
 
 		 226 aa  91.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  38.4 
 
 		 225 aa  91.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  35.45 
 
 		 244 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  36.02 
 
 		 244 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 219 aa  90.1  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  33.03 
 
 		 236 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  33.91 
 
 		 221 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 234 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  32.73 
 
 		 210 aa  87.4  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  44.29 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  34.53 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.59 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  34.93 
 
 		 226 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  34.08 
 
 		 224 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  33.18 
 
 		 229 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  34.38 
 
 		 226 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  36.12 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  32.03 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  35.11 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  33.17 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  33.02 
 
 		 207 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  33.94 
 
 		 221 aa  80.5  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  35.45 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  31.98 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  33.03 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  31.65 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  34.86 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  32.56 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  34.26 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  31.63 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  33.19 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.68 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  32.41 
 
 		 212 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 399 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 208 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  28.71 
 
 		 207 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.91 
 
 		 233 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  31 
 
 		 218 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  32.56 
 
 		 236 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.18 
 
 		 215 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.35 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  32.11 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  29.95 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  28.7 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.39 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.39 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22.75 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  27.36 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  34.53 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  28.7 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.61 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  32.74 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  28.37 
 
 		 211 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 214 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  26.24 
 
 		 208 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  34.39 
 
 		 233 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  28.96 
 
 		 207 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  29.29 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  26.93 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.53 
 
 		 404 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 451 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  33.93 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  30.92 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  29.82 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  36.62 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>