More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  65.7 
 
 
705 aa  238  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  64.25 
 
 
703 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  61.26 
 
 
686 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  58.33 
 
 
243 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  54.46 
 
 
901 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  65.8 
 
 
662 aa  218  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  61.66 
 
 
224 aa  218  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  58.42 
 
 
707 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  59.59 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  58.88 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  57.07 
 
 
688 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  55.61 
 
 
671 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  57.87 
 
 
281 aa  207  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  55.56 
 
 
206 aa  206  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  50.24 
 
 
234 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  62.03 
 
 
688 aa  204  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  56.78 
 
 
686 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  58.62 
 
 
707 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  54.93 
 
 
232 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  53.77 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  59.51 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  53.04 
 
 
221 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  54 
 
 
210 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.75 
 
 
205 aa  184  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  52.17 
 
 
222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  59 
 
 
219 aa  181  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.31 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50 
 
 
202 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.61 
 
 
207 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.42 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  46.89 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.63 
 
 
214 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.63 
 
 
217 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.38 
 
 
211 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.98 
 
 
234 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.61 
 
 
207 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  51.56 
 
 
244 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.96 
 
 
213 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  49.3 
 
 
730 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  48.51 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  47.6 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.86 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  50.51 
 
 
244 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.63 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.14 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.89 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.52 
 
 
217 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.85 
 
 
225 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.73 
 
 
203 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.83 
 
 
208 aa  160  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.24 
 
 
233 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  44.12 
 
 
206 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  44.12 
 
 
206 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  44.12 
 
 
206 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.63 
 
 
206 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.84 
 
 
204 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.19 
 
 
214 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.87 
 
 
225 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  48.31 
 
 
209 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  45.99 
 
 
211 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.35 
 
 
216 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.6 
 
 
215 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.23 
 
 
212 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.69 
 
 
216 aa  157  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.55 
 
 
219 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.52 
 
 
211 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  44.19 
 
 
224 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  45.69 
 
 
197 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.55 
 
 
236 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43.14 
 
 
206 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.03 
 
 
210 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.11 
 
 
209 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43.14 
 
 
206 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.69 
 
 
206 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.38 
 
 
211 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  51.98 
 
 
209 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  39.8 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.06 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  47.96 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.86 
 
 
214 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.78 
 
 
226 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.11 
 
 
199 aa  155  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  50 
 
 
226 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40.89 
 
 
213 aa  154  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.79 
 
 
225 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.06 
 
 
210 aa  154  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  46.89 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.92 
 
 
225 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.29 
 
 
218 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.5 
 
 
212 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.16 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  46.6 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.92 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  43.6 
 
 
224 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40 
 
 
210 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.7 
 
 
221 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  40.4 
 
 
219 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>