More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1941 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  59.8 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  58.71 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 688 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  50 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 230 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  51.96 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  52.53 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.51 
 
 		 688 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 671 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  49 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  49.75 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 686 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  45.31 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  51.03 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  48.7 
 
 		 686 aa  164  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.23 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 281 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  49.19 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  40.1 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 901 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  43.54 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 707 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 246 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  46.95 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  49.25 
 
 		 662 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.93 
 
 		 703 aa  157  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  46.32 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.19 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  46.38 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.06 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 705 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  41.04 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  39.05 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  50.76 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 707 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.3 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.08 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  37.86 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.08 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.93 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.15 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  40.74 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.6 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.51 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  42.79 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  38.19 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  39.81 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  39.47 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>