More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3827 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  95.71 
 
 		 210 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  81.9 
 
 		 210 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  81.43 
 
 		 210 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  80.48 
 
 		 210 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  80.95 
 
 		 210 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  82.13 
 
 		 207 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  80.95 
 
 		 210 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  80.58 
 
 		 210 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  77.4 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  63.55 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  59.02 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  60 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  56.65 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  52.15 
 
 		 219 aa  214  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  53.43 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  58.5 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  54.81 
 
 		 205 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  51.96 
 
 		 203 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  53.27 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  53.2 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  49.05 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  55.44 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  51.96 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  49.74 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  48.76 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  51.96 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  50 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.77 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  50 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  47.8 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 688 aa  177  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  48.56 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  52.43 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.79 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.74 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  45.28 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.07 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 705 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  50.48 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.32 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  53.43 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>