More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0877 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  53.55 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  55.94 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  54.33 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  54.03 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  53.08 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  54.23 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  49.53 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  56.91 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.77 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  56.38 
 
 		 210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  50.25 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 688 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  46.77 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 203 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  46.33 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  50.48 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  48.31 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  49.75 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 210 aa  161  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  45.28 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.66 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.5 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  46.92 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 205 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 204 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.81 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  45.33 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  51.58 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  44.75 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 671 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 707 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.75 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.1 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 901 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  50 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  49.21 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>