More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3412 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  70.14 
 
 		 217 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  69.67 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  62.16 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  61.5 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  64.02 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  66.51 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  62.98 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  64.32 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  60.1 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  54.81 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  54.37 
 
 		 204 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  53.62 
 
 		 203 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  51.01 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  51.52 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  49 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.93 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.66 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  51.76 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  46.19 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.27 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 209 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.47 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.83 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.73 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.08 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  47.55 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.55 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.2 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  43.4 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  38.79 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  45.33 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.31 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.25 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  38.71 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.21 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  37.85 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  45 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  37.17 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.19 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.32 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>