More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2229 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  72.51 
 
 		 217 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  65.71 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  61.84 
 
 		 212 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  61.14 
 
 		 219 aa  256  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  62.86 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  61.9 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  59.38 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  56.08 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.29 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  53.97 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  53.09 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.94 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  48 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  56.08 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  52.45 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.47 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.5 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  50 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  53.44 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  53.44 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.17 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  46.88 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 686 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.75 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.63 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50.51 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.6 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.9 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 686 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  49.74 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.76 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  48.34 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.69 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  50 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.72 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  46.73 
 
 		 688 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 707 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 671 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  48.95 
 
 		 705 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 209 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  50 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.06 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.4 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 688 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  48.42 
 
 		 703 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.41 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.54 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.92 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  48.34 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  47.03 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  42.93 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.98 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.98 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46.34 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.49 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  45.26 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.26 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>