More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1387 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  60.1 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  58.82 
 
 		 204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  60 
 
 		 203 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  59.71 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  58.74 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  58.74 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  58.25 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  58.25 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  58.25 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  58.25 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  58.25 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  57.77 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  57.77 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  57.77 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  57 
 
 		 205 aa  230  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  55.17 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.05 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 217 aa  221  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  54.59 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  55.84 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  50.74 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  50.74 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  55.33 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53.27 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  50.25 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  52.53 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  54.21 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.59 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  51.72 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  53.66 
 
 		 215 aa  187  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  51.74 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  53.03 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  49 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.37 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  45.16 
 
 		 260 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.21 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  45.05 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 688 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 226 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 686 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  48.04 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.35 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.45 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.84 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 686 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.56 
 
 		 901 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.67 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  44.98 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>