More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3388 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  72.99 
 
 		 217 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  72.99 
 
 		 217 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  68.02 
 
 		 260 aa  298  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  68.54 
 
 		 215 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  66.82 
 
 		 225 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  68.33 
 
 		 226 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  66.98 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  62.91 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  59.72 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  54.81 
 
 		 206 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  59.9 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 203 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  54.37 
 
 		 203 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  53.37 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  50.73 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 206 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  48.37 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 206 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  54.17 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  53.37 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 208 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  52.33 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  51.81 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.91 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.66 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.32 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.4 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.02 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  44.98 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.93 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.59 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  46.05 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 209 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.56 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  39.35 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.85 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  45.16 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.63 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  35.89 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  36.67 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  45 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  42.53 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  43.5 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  43.15 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  44.76 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37.93 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.03 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.1 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  37.25 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 203 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  37.32 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  37.96 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.7 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>