More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl676 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  58.02 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.67 
 
 
210 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  41.46 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.98 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  42.36 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  42.36 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  40.58 
 
 
210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.29 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.46 
 
 
210 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.95 
 
 
205 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.11 
 
 
219 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.84 
 
 
206 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.98 
 
 
210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.84 
 
 
219 aa  158  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.06 
 
 
200 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.18 
 
 
213 aa  158  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.93 
 
 
211 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.49 
 
 
212 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  41.06 
 
 
210 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  42.36 
 
 
207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.03 
 
 
213 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  43.78 
 
 
209 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  40.7 
 
 
203 aa  155  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  43.46 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.81 
 
 
211 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.78 
 
 
208 aa  154  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42 
 
 
211 aa  154  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  41.45 
 
 
209 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43 
 
 
203 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.51 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39.39 
 
 
216 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.31 
 
 
214 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.21 
 
 
199 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  39.81 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  39.71 
 
 
208 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  36.74 
 
 
215 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  39.09 
 
 
686 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  39.71 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  39.13 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.69 
 
 
688 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  39.71 
 
 
208 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.3 
 
 
206 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  39.71 
 
 
208 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.9 
 
 
219 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  44.21 
 
 
206 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  37.2 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  41.09 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  42.36 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.71 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  39.9 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.9 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  35.58 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  39.71 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.1 
 
 
214 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.81 
 
 
213 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  37.32 
 
 
217 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.58 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  39.18 
 
 
220 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37.11 
 
 
207 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  37.68 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  38.05 
 
 
215 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.59 
 
 
206 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.16 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  36.84 
 
 
217 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.59 
 
 
225 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  39.11 
 
 
214 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  38.19 
 
 
209 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.12 
 
 
222 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  41.24 
 
 
205 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  40.84 
 
 
210 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  31.9 
 
 
212 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  41.05 
 
 
207 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.82 
 
 
226 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  37.61 
 
 
236 aa  141  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  35.47 
 
 
236 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  39.9 
 
 
204 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  38.61 
 
 
215 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  40.72 
 
 
244 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.89 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.27 
 
 
686 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.24 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  41.71 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  36.71 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  40.84 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.24 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  37.44 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>