More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2154 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  95.63 
 
 
206 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  95.63 
 
 
206 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  88.35 
 
 
206 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  86.89 
 
 
206 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  88.35 
 
 
206 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  86.89 
 
 
206 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  88.35 
 
 
206 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  86.89 
 
 
206 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  86.89 
 
 
206 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  81.55 
 
 
206 aa  347  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  76.7 
 
 
206 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  76.21 
 
 
206 aa  324  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  68.97 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  68.47 
 
 
205 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  67.49 
 
 
205 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  67.65 
 
 
200 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  67.8 
 
 
203 aa  269  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  60.29 
 
 
204 aa  241  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  59.2 
 
 
203 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  57.77 
 
 
205 aa  234  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  60.94 
 
 
211 aa  228  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  59.31 
 
 
214 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.67 
 
 
204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  54.46 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  53.99 
 
 
217 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  51.2 
 
 
211 aa  201  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  53.66 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  57.92 
 
 
233 aa  195  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.49 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.2 
 
 
221 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50 
 
 
210 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.26 
 
 
210 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  55.5 
 
 
226 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.03 
 
 
210 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.57 
 
 
210 aa  188  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.77 
 
 
210 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.5 
 
 
219 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.76 
 
 
207 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.06 
 
 
210 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  51.89 
 
 
220 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  50 
 
 
212 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.06 
 
 
210 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  46.53 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.72 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  46.04 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.85 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  49.28 
 
 
225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  48.33 
 
 
260 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.08 
 
 
218 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.85 
 
 
208 aa  177  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  52.31 
 
 
215 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  49.04 
 
 
228 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  45.27 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.55 
 
 
208 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  46.92 
 
 
226 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  49.76 
 
 
215 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.84 
 
 
705 aa  157  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.02 
 
 
688 aa  157  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.41 
 
 
703 aa  157  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  43.56 
 
 
215 aa  157  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  44.83 
 
 
281 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  46.81 
 
 
234 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  42.93 
 
 
243 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.39 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.58 
 
 
212 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45 
 
 
224 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.5 
 
 
214 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  48.94 
 
 
221 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  43.28 
 
 
210 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.93 
 
 
213 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  44.33 
 
 
662 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45.41 
 
 
214 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.27 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43 
 
 
901 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.88 
 
 
224 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.06 
 
 
213 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.88 
 
 
232 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.28 
 
 
686 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.09 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42 
 
 
671 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.11 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  43.72 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.99 
 
 
215 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.92 
 
 
203 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.22 
 
 
212 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.88 
 
 
688 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  44.39 
 
 
214 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  44.39 
 
 
214 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  42.35 
 
 
226 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.71 
 
 
686 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.03 
 
 
210 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.62 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  40.09 
 
 
209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.81 
 
 
199 aa  144  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>