More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1577 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  99.55 
 
 
223 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  53.62 
 
 
218 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  52.22 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  50.48 
 
 
214 aa  211  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.43 
 
 
210 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  48.06 
 
 
212 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  50.74 
 
 
205 aa  208  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  53.12 
 
 
210 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  51.22 
 
 
210 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  52.33 
 
 
207 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.79 
 
 
210 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.74 
 
 
210 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  50 
 
 
208 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  51.44 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  50.98 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.79 
 
 
210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.74 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.97 
 
 
211 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  47.85 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  46.77 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  48.74 
 
 
206 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.67 
 
 
219 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.31 
 
 
206 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  47.83 
 
 
206 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.28 
 
 
200 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.8 
 
 
205 aa  188  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  49.27 
 
 
203 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  50.97 
 
 
219 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  54.31 
 
 
212 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  46.04 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  46.12 
 
 
205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  47.52 
 
 
204 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  45.63 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.63 
 
 
206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  45.63 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  45.63 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.78 
 
 
204 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.89 
 
 
206 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.39 
 
 
219 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.15 
 
 
206 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.15 
 
 
206 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.15 
 
 
206 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.07 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  47.26 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.04 
 
 
221 aa  171  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  43.14 
 
 
212 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  43.14 
 
 
212 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  45.67 
 
 
225 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.47 
 
 
213 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.66 
 
 
208 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  45.93 
 
 
212 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.51 
 
 
216 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  46.34 
 
 
212 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  45.85 
 
 
212 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.72 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  43.78 
 
 
210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  42.16 
 
 
208 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  42.51 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  42.16 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  42.16 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  42.16 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  42.51 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  42.58 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.37 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.06 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.37 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.44 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  42.16 
 
 
209 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.24 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  41.95 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.39 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  42.36 
 
 
210 aa  161  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.33 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  46.6 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  47.09 
 
 
225 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.96 
 
 
233 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  44.44 
 
 
208 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  44.39 
 
 
206 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  44.71 
 
 
213 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  41.35 
 
 
230 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.15 
 
 
217 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  42.16 
 
 
209 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  42.16 
 
 
209 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  43.35 
 
 
215 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.13 
 
 
215 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  41.46 
 
 
222 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  42.25 
 
 
230 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  47.19 
 
 
219 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  44.5 
 
 
213 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  43.96 
 
 
209 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.89 
 
 
703 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.21 
 
 
213 aa  158  8e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>