More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1275 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  63.05 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  60.75 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  56.37 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 281 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  53.33 
 
 		 901 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 243 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  55.67 
 
 		 662 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  51.69 
 
 		 703 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 705 aa  188  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  50.52 
 
 		 221 aa  185  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  49.5 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 686 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 707 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  47.29 
 
 		 688 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.6 
 
 		 688 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 671 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 686 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.29 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.12 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 730 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.79 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 707 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.27 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.27 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.19 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.11 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.39 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.49 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  40.8 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.76 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.75 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.1 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  50.75 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.56 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.83 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.12 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  40.09 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  49.25 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.58 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  43.5 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>