More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1613 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  85.92 
 
 
213 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  85.92 
 
 
213 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  85.92 
 
 
213 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  85.92 
 
 
213 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  85.92 
 
 
213 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  86.38 
 
 
213 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  70.28 
 
 
212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  69.67 
 
 
219 aa  300  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  72.5 
 
 
219 aa  295  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  69.34 
 
 
212 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  69.34 
 
 
212 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  68.87 
 
 
212 aa  293  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  66.67 
 
 
215 aa  284  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  64.25 
 
 
210 aa  281  6.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  66.83 
 
 
217 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  60.66 
 
 
209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  60.19 
 
 
210 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  60 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  61.17 
 
 
210 aa  248  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  54.33 
 
 
223 aa  222  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  54.46 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  54.41 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  52.68 
 
 
209 aa  218  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  53.92 
 
 
208 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  53.92 
 
 
208 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  53.92 
 
 
208 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  55.78 
 
 
215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  52.68 
 
 
212 aa  215  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  50.7 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  52.94 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  54.15 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  51.96 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  52.45 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  52.45 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  54.55 
 
 
210 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  53.17 
 
 
208 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  51.46 
 
 
212 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  53.54 
 
 
210 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  52.45 
 
 
209 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  53.08 
 
 
210 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  50.49 
 
 
212 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.07 
 
 
210 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.89 
 
 
218 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.07 
 
 
210 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.71 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.67 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.76 
 
 
210 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.45 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.85 
 
 
205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.46 
 
 
208 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.44 
 
 
210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.33 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.71 
 
 
223 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.71 
 
 
223 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  46.12 
 
 
219 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.08 
 
 
211 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  42.72 
 
 
214 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.12 
 
 
217 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.8 
 
 
212 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.23 
 
 
206 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.15 
 
 
207 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  41.06 
 
 
204 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.96 
 
 
203 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.92 
 
 
212 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  42.03 
 
 
206 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.55 
 
 
206 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.55 
 
 
206 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  44.44 
 
 
209 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.28 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.58 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.03 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.02 
 
 
215 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.31 
 
 
210 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  40.67 
 
 
206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  40.67 
 
 
206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  42.93 
 
 
200 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.8 
 
 
203 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  36.76 
 
 
197 aa  141  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  41.9 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>