More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0696 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  56.85 
 
 		 199 aa  234  7e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  55.21 
 
 		 197 aa  197  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  53.12 
 
 		 197 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.23 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.86 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.22 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.1 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  45.64 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.3 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.41 
 
 		 686 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.1 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.79 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 688 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  45.03 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.19 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.45 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  39.18 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 209 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 209 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.31 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  42.02 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.5 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.49 
 
 		 686 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.54 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.86 
 
 		 688 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.95 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  41.38 
 
 		 219 aa  151  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  40.1 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.61 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  37.17 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  43.43 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  39.38 
 
 		 671 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 901 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40.21 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.6 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.18 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  39.27 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  39.51 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  39.57 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  39.5 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  37.89 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  36.14 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  42 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  37.63 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.18 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.89 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>