More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2197 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  64.68 
 
 		 200 aa  254  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  64.04 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  62.56 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  60.3 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  62.25 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  62.25 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  61.76 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  61.76 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  62.25 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  62.07 
 
 		 206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  61.27 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  61.27 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  61.27 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  61.27 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  61.27 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  60.78 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  60.78 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  58.82 
 
 		 205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  59.8 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  60.29 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  230  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  57.07 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  56 
 
 		 218 aa  217  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  54.95 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  57.29 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  53.43 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  55.17 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  55.05 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  55.67 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  53.23 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.45 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  52.17 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  54.37 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  52.79 
 
 		 212 aa  200  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  56.61 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  51.23 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  52.53 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  46.79 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  53.73 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  45.62 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.04 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  48.47 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.5 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  50 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.47 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  46.8 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  50.26 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.28 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.75 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.59 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 686 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 688 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.89 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 209 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  44.33 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.48 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.08 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.85 
 
 		 244 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 901 aa  154  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.46 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.59 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.92 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  49.47 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>