More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2783 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 686 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  100 
 
 		 686 aa  1348    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  54.57 
 
 		 688 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  60.83 
 
 		 707 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  51.32 
 
 		 688 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  49.13 
 
 		 901 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 707 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  45.8 
 
 		 730 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  49.7 
 
 		 662 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  44.96 
 
 		 709 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.7 
 
 		 705 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.05 
 
 		 703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 727 aa  428  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 725 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 642 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  56.41 
 
 		 222 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  56.78 
 
 		 213 aa  204  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  52.58 
 
 		 207 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  56.28 
 
 		 225 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  52.55 
 
 		 232 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  54.17 
 
 		 226 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  53.8 
 
 		 234 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  47.52 
 
 		 216 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  50.75 
 
 		 207 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 224 aa  183  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 205 aa  183  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 208 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 207 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  49.04 
 
 		 222 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.23 
 
 		 215 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 215 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 210 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 210 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 225 aa  180  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 243 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 236 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 217 aa  177  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 210 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 226 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 206 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 210 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.97 
 
 		 207 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 213 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  174  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.54 
 
 		 210 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 211 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 202 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 210 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.28 
 
 		 213 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.27 
 
 		 224 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 221 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 210 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 219 aa  171  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.5 
 
 		 204 aa  170  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.08 
 
 		 214 aa  170  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 234 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 217 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 213 aa  168  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.55 
 
 		 207 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 215 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.75 
 
 		 203 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 217 aa  167  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 210 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.38 
 
 		 221 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.78 
 
 		 219 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 218 aa  165  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  47.92 
 
 		 244 aa  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 211 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 205 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  48.7 
 
 		 209 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 210 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 213 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.92 
 
 		 244 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 210 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 212 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.78 
 
 		 218 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.32 
 
 		 210 aa  163  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.41 
 
 		 197 aa  163  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 234 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  47.45 
 
 		 226 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 211 aa  162  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.91 
 
 		 210 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 216 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  45.96 
 
 		 236 aa  161  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 281 aa  161  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.37 
 
 		 208 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  44.85 
 
 		 213 aa  160  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 225 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 233 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  41.03 
 
 		 209 aa  160  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  43.65 
 
 		 208 aa  160  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 214 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.69 
 
 		 211 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 219 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 208 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.5 
 
 		 212 aa  160  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>