More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1416 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  66.01 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  59.51 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  60.4 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  58.45 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 205 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  55.77 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  60.5 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  57 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  57.49 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  57.97 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  59.39 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  58.5 
 
 		 210 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  57.5 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  50 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  55.4 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  51.78 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  54.03 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  53.89 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  53.66 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  47.12 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  51.83 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  56.25 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  54.74 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  56.78 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  50.73 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  46.4 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  48.44 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  49.49 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  48.04 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  47.44 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  47.44 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  46.98 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.81 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  50.71 
 
 		 244 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  48.04 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  49.48 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  52.33 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  42.52 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  49.3 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.4 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 686 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  39.79 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.8 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  44.95 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>