More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1665 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  61.61 
 
 		 217 aa  267  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  61.84 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  61.27 
 
 		 212 aa  262  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  61.14 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  59.82 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  59.45 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  58.42 
 
 		 216 aa  237  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  50.5 
 
 		 214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 901 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  51.42 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 206 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.57 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  50.24 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.63 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  45.67 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.8 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.24 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 686 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.57 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  44.81 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.63 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.08 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 214 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  45.58 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 707 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  46.01 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  44.66 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 688 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.99 
 
 		 688 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 705 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  42.79 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.01 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  51.34 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  40.89 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.86 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  44.71 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.2 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 209 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 202 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.31 
 
 		 703 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  44.28 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.62 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.16 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  42.86 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 686 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.4 
 
 		 671 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  44.95 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.65 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  43.26 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.12 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>