More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0240 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.62 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  48.57 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  53.06 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  46 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  46 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  46 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  46 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  46 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.66 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  46.84 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 210 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  45.99 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.52 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 901 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.71 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  43.43 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  41.78 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  47.37 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  42.86 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  47.67 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.49 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  46.43 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  45.81 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  37.86 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  43.28 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  43.55 
 
 		 281 aa  148  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.55 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  37.74 
 
 		 209 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  40 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  37.68 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.7 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  38.18 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.44 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  46.77 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>