More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0922 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  72.36 
 
 		 208 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  65.84 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  69.15 
 
 		 199 aa  245  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  54.23 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  50.48 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.06 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  51.04 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  52.41 
 
 		 225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  45.55 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.89 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48.95 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  158  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  47.31 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.15 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.95 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  48.74 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  46.67 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 230 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.22 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  44.06 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  43 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  40.3 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  45.96 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.43 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  46.81 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.05 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  42.86 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  44.68 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  42.03 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 246 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  39.7 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.03 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  37 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.79 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.22 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  39.59 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  41.26 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  43.88 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.8 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.61 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.31 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.31 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.21 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  39.7 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.67 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.62 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  41 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>